Возникновение археоптерикса как предполагаемого прародителя птиц считается идиоадаптацией, то есть адаптацией к определенным условиям среды, которая привела к формированию уникальных признаков у данного организма. Дегенерация обычно относится к процессу потери или уменьшения функции органов или характеристик организма, что не является случаем с археоптериксом.