Дипептид образуется при соединении двух аминокислот посредством образования пептидной связи. Формула образования дипептида может быть представлена следующим образом:

H2N-CH(R1)-COOH + H2N-CH(R2)-COOH → H2N-CH(R1)-CO-NH-CH(R2)-COOH + H2O

где R1 и R2 обозначают различные боковые группы аминокислот, а H2O представляет собой молекулу воды, выделяющуюся в процессе образования пептидной связи.