Бактерии-паразиты отличаются от сапротрофов тем, что они получают питание, паразитируя на других организмах, часто вызывая вред им. Бактерии-паразиты обычно внедряются в живые клетки своих хозяев и потребляют их содержимое для получения энергии и питательных веществ. Сапротрофы, напротив, питаются мертвыми органическими веществами, разлагая их на более простые соединения.