Клетка простейших обычно имеет довольно простое строение, состоящее из одной клетки без ядра и внутриклеточных органелл. Они обладают минимальным набором структур, необходимых для жизнедеятельности, таких как цитоплазма, мембрана, митохондрии, аппарат Гольджи и т.д.

Клетки простейших считаются самостоятельными организмами, потому что каждая клетка способна к самостоятельной жизни, питанию и размножению. Они находятся на самом низшем уровне организации живой материи и не являются частями более сложных организмов, как это бывает с клетками других организмов. Клетки простейших способны к самостоятельному обмену веществ, движению и реакциям на внешние раздражители, что позволяет им существовать как отдельные, независимые организмы.