Главная функция комплекса Гольджи – это производство, модификация и упаковка молекулярных веществ, таких как белки и липиды, для дальнейшей доставки по клетке или за её пределы. Считается, что комплекс Гольджи также участвует в образовании лизосом и в регуляции клеточных процессов.