Положительные значения корненожек, жгутиковых и инфузорий заключаются в их роли в экосистеме. Корненожки и жгутиковые являются важными частями планктона, которые играют ключевую роль в пищевой цепи, участвуют в процессе фильтрации воды и являются питательной базой для многих организмов.

Отрицательные значения могут быть связаны с возможным перенаселением и размножением корненожек, жгутиковых и инфузорий, что может привести к дисбалансу в экосистеме и ухудшению качества воды. Также некоторые виды инфузорий могут быть патогенными и вызывать болезни у рыб и других животных.