Соседние нуклеотиды в цепи ДНК и РНК связаны между собой за счет гидрофобных взаимодействий, водородных связей и электростатических взаимодействий. Гидрофобные взаимодействия происходят между гидрофобными участками нуклеотидов, водородные связи образуются между комплиментарными основаниями (аденин-тимин, гуанин-цитозин) и фосфатными группами, а электростатические взаимодействия происходят между заряженными группами нуклеотидов.