Аллельные гены - это различные варианты одного и того же гена, которые находятся на соответствующих хромосомах в гомологичных позициях. В диплоидных организмах каждая клетка содержит два набора хромосом - один от матери и один от отца. Из-за этого в каждой клетке присутствуют две копии каждого гена, и могут быть две разные версии (аллели) этого гена.

В гаплоидных организмах, таких как бактерии или грибы, у них есть только один набор хромосом, поэтому каждая клетка содержит только одну копию каждого гена. В результате, аллельные гены не могут существовать, потому что в этом случае нет альтернативной версии гена для формирования пары аллелей.