Красные водоросли имеют цвет красного оттенка, зелёные - зелёный цвет, бурые - коричневый. Особенность красных водорослей заключается в том, что они содержат фикобилипротеины, которые придают им красный цвет. Зелёные водоросли содержат хлорофилл, поэтому они зелёного цвета. Бурые водоросли содержат фукоксантин, который придает им коричневый цвет.