Организм распознает доминантный и рецессивный гены на основе их влияния на фенотип (внешние проявления) организма. Доминантный ген проявляется в фенотипе, даже если организм является гетерозиготным (имеет один доминантный и один рецессивный аллели). Рецессивный же ген проявляется только в случае, если оба аллеля генов в гомозиготном состоянии (оба аллеля одинаковы).

Таким образом, организм распознает доминантный ген по его способности доминировать в проявлении признаков на уровне фенотипа.