Наличие зачатков жаберных щелей и хорды у зародышей млекопитающих свидетельствует о их эволюционном происхождении от общего предка с рыбами. Эти признаки также указывают на то, что у млекопитающих имеется общее происхождение с другими хордовыми животными. Таким образом, развитие зародышей млекопитающих является отражением их филогенетической истории.

Сходство процессов размножения пресмыкающихся и млекопитающих заключается в том, что оба класса являются достоверными термофилами, что означает, что их тела способны самостоятельно производить и сохранять тепло. Однако, есть и отличия размножения. Например, у млекопитающих происходит внутреннее оплодотворение, развитие плода внутри матки и роды через живорождение. У пресмыкающихся, как правило, происходит внешнее оплодотворение, а потомки остаются независимыми сразу после вылупления из яиц. Кроме того, у птиц также внешнее оплодотворение, но они откладывают яйца и затем вывивают потомство.