В английском языке правильно будет сказать "It has got two eyes." Формулировка "It's got two eyes" также принята в разговорной речи, где "it's" является сокращением от "it has." Оба варианта могут использоваться, но "has got" является более формальным. Если вы хотите использовать более стандартный и формальный вариант, лучше использовать "It has got two eyes."