Как оценить токсичность и мобильность новых химических веществ в окружающей среде, используя принципы структурно‑активностной зависимости (QSAR), биодеградации и моделирования распределения между средами?
Краткий рабочий план и ключевые формулы для оценки токсичности и мобильности новых веществ в окружающей среде с применением QSAR, биодеградации и моделирования распределения. Основная последовательность: 1. Сбор исходных данных: структурная формула, молекулярная масса, группы, pKa (если ионизируемое). 2. Предсказание физико‑химических свойств (QSAR/СПР): logKOW\log K_{OW}logKOW, растворимость SwS_wSw, коэффициент Генри HHH, logKOC\log K_{OC}logKOC, BCFBCFBCF, константы pKa. Инструменты: EPI Suite (KOWWIN, KOCWIN, BIOWIN), OECD QSAR Toolbox, VEGA, QSARINS. 3. Оценка биоразложения: предсказание кинетики (модели BIOWIN, готовность к биодеградации) → получение скорости распада kkk или полу‑времени t1/2t_{1/2}t1/2. 4. Оценка токсичности (QSAR): предсказать LC50\text{LC}_{50}LC50, EC50\text{EC}_{50}EC50, NOEC\text{NOEC}NOEC, механистические предупреждения; проверить область применимости и верифицировать экспериментально при возможности. 5. Оценка сорбции и мобильности в почве/воде: вычислить KdK_dKd из KOCK_{OC}KOC и органического углерода: Kd=KOC⋅fOC
K_d = K_{OC}\cdot f_{OC} Kd=KOC⋅fOC
приближенная связь с logKOW\log K_{OW}logKOW: logKOC≈alogKOW+b
\log K_{OC} \approx a\log K_{OW} + b logKOC≈alogKOW+b
(используйте конкретную корреляцию из выбранной модели). 6. Оценка мобильности (фракция в поровой воде): для почвы с плотностью ρb\rho_bρb и водонасыщением θ\thetaθ: fpw=11+Kd⋅ρbθ
f_{pw} = \frac{1}{1 + K_d\cdot \frac{\rho_b}{\theta}} fpw=1+Kd⋅θρb1
чем выше fpwf_{pw}fpw — тем выше риск выноса в грунтовые воды. 7. Мультимедийное моделирование распределения (Mackay fugacity, Level II/III, SimpleBox): массовый баланс в барьерах: dMidt=∑jFji−∑jFij−kiMi+Si
\frac{dM_i}{dt} = \sum_j F_{ji} - \sum_j F_{ij} - k_i M_i + S_i dtdMi=j∑Fji−j∑Fij−kiMi+Si
где MiM_iMi — масса в среде iii, FijF_{ij}Fij — потоки между средами, kik_iki — локальная скорость распада, SiS_iSi — источники. 8. Кинетика распада (первого порядка) и полу‑время: C(t)=C0e−kt,t1/2=ln2k.
C(t)=C_0 e^{-k t},\qquad t_{1/2}=\frac{\ln 2}{k}. C(t)=C0e−kt,t1/2=kln2.
9. Интегральные метрики: общая устойчивость (overall persistence) и LRTP (потенциальная дальность переноса). Простейшая оценка устойчивости через средневзвешенное время жизни: Pov=∑iτiMiMtot,τi=1ki.
P_{ov}=\sum_i \tau_i\frac{M_i}{M_{tot}},\qquad \tau_i=\frac{1}{k_i}. Pov=i∑τiMtotMi,τi=ki1.
10. Оценка риска: сравнить предсказанные концентрации (PEC) с порогами (PNEC, получаемыми из NOEC/AF\text{NOEC}/AFNOEC/AF или LC50/AF\text{LC}_{50}/AFLC50/AF). Простейшее отношение: RQ=PECPNEC.
\text{RQ}=\frac{PEC}{PNEC}. RQ=PNECPEC. Практические замечания и погрешности: - Для ионизируемых соединений учитывайте зависимость сорбции и растворимости от pH (модель распределения по формам). - QSAR‑предсказания надо проверять на область применимости; использовать несколько моделей и consensus‑оценку. - Метаболиты/продукты трансформации могут иметь иные токсичность/мобильность — включайте предсказание метаболитов. - Валидация: по возможности сделайте лабораторные тесты (акутные/хронические токсичности, тесты биодеградации, измерение Kd/Koc, BCF). Короткая сводка инструментов: - EPI Suite (KOWWIN, KOCWIN, BIOWIN, BCFBAF), OECD QSAR Toolbox, VEGA, Mackay Level III/III (Multimedia models), SimpleBox/ECOSAR (экотоксичность), QSARINS. Итого: используйте каскад — предсказание физико‑химических свойств (QSAR) → предсказание биодеградации (полу‑времена) → расчёт сорбции и мобильности (KdK_dKd, fpwf_{pw}fpw) → мультимедийное моделирование концентраций → сравнение PEC/PNEC и оценка риска; параллельно проверяйте область применимости моделей и при необходимости верифицируйте экспериментально.
Основная последовательность:
1. Сбор исходных данных: структурная формула, молекулярная масса, группы, pKa (если ионизируемое).
2. Предсказание физико‑химических свойств (QSAR/СПР): logKOW\log K_{OW}logKOW , растворимость SwS_wSw , коэффициент Генри HHH, logKOC\log K_{OC}logKOC , BCFBCFBCF, константы pKa. Инструменты: EPI Suite (KOWWIN, KOCWIN, BIOWIN), OECD QSAR Toolbox, VEGA, QSARINS.
3. Оценка биоразложения: предсказание кинетики (модели BIOWIN, готовность к биодеградации) → получение скорости распада kkk или полу‑времени t1/2t_{1/2}t1/2 .
4. Оценка токсичности (QSAR): предсказать LC50\text{LC}_{50}LC50 , EC50\text{EC}_{50}EC50 , NOEC\text{NOEC}NOEC, механистические предупреждения; проверить область применимости и верифицировать экспериментально при возможности.
5. Оценка сорбции и мобильности в почве/воде: вычислить KdK_dKd из KOCK_{OC}KOC и органического углерода:
Kd=KOC⋅fOC K_d = K_{OC}\cdot f_{OC}
Kd =KOC ⋅fOC приближенная связь с logKOW\log K_{OW}logKOW :
logKOC≈alogKOW+b \log K_{OC} \approx a\log K_{OW} + b
logKOC ≈alogKOW +b (используйте конкретную корреляцию из выбранной модели).
6. Оценка мобильности (фракция в поровой воде): для почвы с плотностью ρb\rho_bρb и водонасыщением θ\thetaθ:
fpw=11+Kd⋅ρbθ f_{pw} = \frac{1}{1 + K_d\cdot \frac{\rho_b}{\theta}}
fpw =1+Kd ⋅θρb 1 чем выше fpwf_{pw}fpw — тем выше риск выноса в грунтовые воды.
7. Мультимедийное моделирование распределения (Mackay fugacity, Level II/III, SimpleBox): массовый баланс в барьерах:
dMidt=∑jFji−∑jFij−kiMi+Si \frac{dM_i}{dt} = \sum_j F_{ji} - \sum_j F_{ij} - k_i M_i + S_i
dtdMi =j∑ Fji −j∑ Fij −ki Mi +Si где MiM_iMi — масса в среде iii, FijF_{ij}Fij — потоки между средами, kik_iki — локальная скорость распада, SiS_iSi — источники.
8. Кинетика распада (первого порядка) и полу‑время:
C(t)=C0e−kt,t1/2=ln2k. C(t)=C_0 e^{-k t},\qquad t_{1/2}=\frac{\ln 2}{k}.
C(t)=C0 e−kt,t1/2 =kln2 . 9. Интегральные метрики: общая устойчивость (overall persistence) и LRTP (потенциальная дальность переноса). Простейшая оценка устойчивости через средневзвешенное время жизни:
Pov=∑iτiMiMtot,τi=1ki. P_{ov}=\sum_i \tau_i\frac{M_i}{M_{tot}},\qquad \tau_i=\frac{1}{k_i}.
Pov =i∑ τi Mtot Mi ,τi =ki 1 . 10. Оценка риска: сравнить предсказанные концентрации (PEC) с порогами (PNEC, получаемыми из NOEC/AF\text{NOEC}/AFNOEC/AF или LC50/AF\text{LC}_{50}/AFLC50 /AF). Простейшее отношение:
RQ=PECPNEC. \text{RQ}=\frac{PEC}{PNEC}.
RQ=PNECPEC .
Практические замечания и погрешности:
- Для ионизируемых соединений учитывайте зависимость сорбции и растворимости от pH (модель распределения по формам).
- QSAR‑предсказания надо проверять на область применимости; использовать несколько моделей и consensus‑оценку.
- Метаболиты/продукты трансформации могут иметь иные токсичность/мобильность — включайте предсказание метаболитов.
- Валидация: по возможности сделайте лабораторные тесты (акутные/хронические токсичности, тесты биодеградации, измерение Kd/Koc, BCF).
Короткая сводка инструментов:
- EPI Suite (KOWWIN, KOCWIN, BIOWIN, BCFBAF), OECD QSAR Toolbox, VEGA, Mackay Level III/III (Multimedia models), SimpleBox/ECOSAR (экотоксичность), QSARINS.
Итого: используйте каскад — предсказание физико‑химических свойств (QSAR) → предсказание биодеградации (полу‑времена) → расчёт сорбции и мобильности (KdK_dKd , fpwf_{pw}fpw ) → мультимедийное моделирование концентраций → сравнение PEC/PNEC и оценка риска; параллельно проверяйте область применимости моделей и при необходимости верифицируйте экспериментально.