Функциональные группы аминокислот, которые участвуют в образовании белков, включают аминогруппу (NH2), которая является основанием для образования пептидных связей, и карбоксильную группу (COOH), которая также участвует в образовании пептидных связей. Также некоторые аминокислоты содержат боковые цепи, такие как гидроксильные группы (-OH), аминогруппы (-NH2), карбоксиловые группы (-COOH) и другие, которые также могут участвовать в образовании белков через взаимодействие с другими аминокислотами в цепочке.