Потому что в Империи Чингиза была установлена свобода вероисповедания. Кстати - вторым государством в мире, где также декларировалось подобное - были США. Даже среди монголов были не только шаманисты, но и христиане, и буддисты, и мусульмане. Сам Чингизхан по некоторым сведениям в конце жизни склонялся к даосизму.

Следовательно - никакого притеснения по "религиозному признаку" на землях завоеванных монголами не было.

Именно религиозная терпимость была причиной по которой Александр Невский (побратим сына Батыя) - отказался от предложения крестоносцев объединится против монголов.