При Иване 4 в церкви произошли значительные перемены. Он начал активно бороться за церковную независимость от Западной церкви, основав в 1589 году русскую патриаршию. Также была проведена реформа церковного управления, укреплена централизация власти в руках царя. Кроме того, Иван 4 активно поддерживал церковь в ее деятельности и финансировании.

Взаимоотношения между царем и церковью в период правления Ивана 4 были весьма сложными. С одной стороны, царь старался укрепить церковь и использовать ее в качестве поддержки своего авторитета. С другой стороны, церковь стремилась сохранить свою независимость и влияние, что иногда приводило к конфликтам с царской властью. Однако в целом царь и церковь сотрудничали друг с другом в деле укрепления государства и церкви в России.