Число 100 увеличилось на большее количество процентов.

Рассмотрим:

Изначально число 100 увеличилось на 1%, став 101.Изначально число 1000 увеличилось на 0.1%, став 1000.1.

Таким образом, число 100 увеличилось на 1%, в то время как число 1000 увеличилось всего на 0.1%.