Да, синтаксический состав предложения "Глухой, дремучий лес" изменится при изменении порядка слов, так как в русском языке порядок слов в предложении имеет большое значение для выражения смысла. Например, если мы поменяем местами слова "дремучий" и "лес", то предложение станет "Глухой, лес дремучий", что уже несет другой смысл и изменяет основное выражение о лесе, что он не только глухой, но и дремучий.