Слово "начинает" состоит из следующих морфем:

начин- (основа слова)
-а- (морфема времени и наклонения, обозначает настоящее время)
-ет (суффикс 3 лица единственного числа настоящего времени глагола)

Таким образом, слово "начинает" имеет приставку "начин-", морфему времени и наклонения "-а-" и суффикс 3 лица единственного числа настоящего времени глагола "-ет".