Суффиксы -енн- и -онн- в русском языке произошли от древних славянских форм. Происхождение двух букв Н в этих суффиксах связано с фонетическими процессами, происходящими в русском языке.

Написание этих суффиксов с двумя буквами Н можно объяснить следующим образом. В древнерусском языке суффиксы -енн- и -онн- обозначали длительность, интенсивность действия или процесса. При этом непосредственно перед ними стояли корневые согласные окончания глаголов, которые могли быть глухими или звонкими. При добавлении суффикса -енн- или -онн- к таким корневым согласным происходило удвоение согласной перед суффиксом для сохранения произношения. В результате возникли написания с двумя буквами Н.

Таким образом, написание суффиксов -енн- и -онн- с двумя буквами Н сохраняет древние фонетические процессы и отражает их происхождение от славянских форм.