Да, в данном случае перед союзом "как" нужно поставить запятую. Правильно будет: "Церковь была восстановлена, как храм?"
Да, в данном случае перед союзом "как" нужно поставить запятую. Правильно будет: "Церковь была восстановлена, как храм?"