Вы правильно заметили, что в данном выражении "втуне" происходит использование предлога "в" и слова "туне", которое в данном случае является устаревшим словом и означает "напрасно, впустую". Слово "туне" имеет древнегреческое происхождение и встречается в старинных текстах, означая тщету, пустоту, бесполезность. Таким образом, выражение "пропасть втуне" означает тратить что-то напрасно, безрезультатно, впустую.