Фраза "бежит рысью" имеет переносное значение, потому что она не относится к действию бега настоящего животного, а используется для описания быстрого движения или действия человека или предмета. Вода действительно не может бегать, поэтому это выражение не имеет прямого значения. Оно используется для передачи идеи быстроты и плавности движения, как у рыси - быстрого и грациозного хищного млекопитающего.