Грамматика языка уже неоднократно изменялась и совершенствовалась в течение истории. Некоторые слова могут иметь неочевидное происхождение и образование, которое может привести к путанице в их расчете. В случае с словом "бессмертный", приставка "бесс-" имеет отрицательное значение ("без"), в сочетании со словом "смертный" образуется новое слово с противоположным значением. Это является правилом образования слов в русском языке. Не всегда логика может совпадать с формами слов, но они все же подчиняются грамматическим правилам и нормам языка.