Вторая цепь ДНК имеет антипараллельное строение к первой цепи, что означает, что направление нуклеотидов идет в противоположном направлении.

Для построения молекулы РНК на второй цепи ДНК необходимо использовать комплементарную цепь, где каждый нуклеотид РНК будет соответствовать нуклеотиду ДНК согласно правилам паросочетания (A-U, T-A, G-C, C-G).

Пример молекулы РНК на второй цепи ДНК:

ДНК: 5'-A-T-G-C-G-C-T-A-3'
РНК: 3'-U-A-C-G-C-G-A-U-5'