Амёба полезна для человека преимущественно в качестве объекта исследований в биологии и медицине. Изучение структуры и функций амёб позволяет углубленно изучать механизмы жизнедеятельности клеток, их способы передвижения, обмена веществ и размножения.

Также амёба используется для тестирования эффективности различных лекарств и борьбы с инфекционными заболеваниями, такими как амёбиаз, вызываемая различными видами амёб.