Рефлекторная регуляция органов пищеварения происходит за счет возбуждения нервных рецепторов при поступлении пищи в желудок или кишечник. Примеры включают в себя возбуждение слизистым оболочкой желудка при поступлении пищи, что приводит к выделению соляной кислоты и энзимов для переваривания пищи.

Гуморальная регуляция органов пищеварения осуществляется за счет гормонов, выделяемых различными железами. Примером может служить выделение гастрином желудочных клеток, стимулирующим секрецию желудочного сока для переваривания пищи.