Ядро в клетке хлореллы выполняет функцию контроля над клеточными процессами, такими как синтез белков, рост и деление клеток, а также хранение и передача генетической информации в форме ДНК. Кроме того, ядро регулирует метаболические процессы и участвует в реакции клетки на внешнюю среду.