Простейшие в природе, такие как бактерии и водоросли, играют важную роль в экосистеме. Они участвуют в разложении органических веществ, в процессе образования почвы, в цикле питания как пища для других организмов, а также выполняют функции биоиндикаторов качества окружающей среды. Без простейших организмов, сложные формы жизни на Земле не смогли бы существовать.