Эукариоты и прокариоты различаются строением и организацией клетки, хотя некоторые аспекты их строения могут быть схожи. Несмотря на примитивность строения, эукариоты обладают рядом преимуществ перед прокариотами, такими как более сложная организация клетки, наличие ядра, мембранных органелл (митохондрий, хлоропластов и др.), что позволяет им выполнять более сложные функции. Кроме того, эукариоты способны образовывать многоклеточные организмы, такие как растения, животные и грибы. В результате этих преимуществ эукариотам удалось выжить и разнообразиться наряду с прокариотами.