Ген, контролирующий производство определенного фермента, может влиять на выражение другого гена, регулирующего уровень метаболитов в клетке.

Наличие определенных генетических вариантов может влиять на чувствительность организма к воздействию определенных негативных факторов окружающей среды, что может привести к изменению проявления других генов.

Гены, контролирующие целочисленные черты, такие как количество плодов или количество потомства, могут влиять на проявление других генов, регулирующих другие аспекты фенотипа.

Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболических путях, могут влиять на проявление других генов, регулирующих другие этапы этих путей.

Гены, контролирующие развитие определенных тканей или органов, могут влиять на проявление других генов, регулирующих функции этих тканей или органов.