Мукор обитает в почве, гниющей растительности, гнилых плодах, а также в воде и воздухе. Он предпочитает влажные и теплые условия, поэтому часто встречается в тропических и субтропических районах. Мукор может быть найден как на поверхности почвы, так и в ее глубинах, где он разлагает органические материалы и помогает переработке остатков растений.