Скелет пресмыкающихся в основном состоит из костей, которые обеспечивают опору и защиту органов внутренних систем. Кости позвоночника у пресмыкающихся часто имеют более длинные позвонки, что обеспечивает им большую гибкость и подвижность на суше. Кости конечностей также адаптированы для передвижения по суше: например, у змей конечности отсутствуют, благодаря чему они могут передвигаться ползком. Покрытие кожи у пресмыкающихся также обеспечивает защиту от высыхания на суше. Кроме того, у некоторых видов пресмыкающихся (например, черепах) имеются защитные панцири, которые защищают их от хищников.