Биоценоз прекратит свое существование, если произойдут серьезные изменения в его экологических условиях, например, из-за загрязнения воды или почвы, изменения климата, внезапных естественных катастроф или нарушения экосистемы человеческой деятельностью (вырубка лесов, загрязнение атмосферы, перенаселение и т. д.). Эти факторы могут привести к вымиранию видов, нарушению пищевых цепей, ухудшению условий жизни для организмов и, в конечном итоге, к гибели биоценоза в целом.