Процес розщеплення білків в організмі відбувається під впливом ферментів, відомих як протеази або протеолітичні ферменти. Ці ферменти діляться на декілька груп залежно від механізму їх дії, наприклад, трипсин, пепсин, хімотрипсин, карбоксипептидази та інші. Кожен з цих ферментів розщеплює білки на амінокислотні залишки, що потім можуть бути використані для синтезу нових білків або для інших біологічних процесів.