Амеба обладает специальным механизмом, который позволяет избежать разрушения собственной клетки ферментами лизосом. При появлении пищевого вакуоля, содержащего пищу, амеба образует плазматическую мембрану вокруг него, образуя так называемый фагосом. Затем фагосом объединяется с лизосомой, образуя фаголизосому, в которой ферменты лизосом не смогут повредить клетку амебы, поскольку они защищены мембраной фагосома. Амеба затем использует ферменты лизосом для переваривания пищи в фаголизосоме, а затем поглощает питательные вещества через мембрану фаголизосомы.