Цианобактерии могут размножаться путем деления клеток, образования эндоспор или брожения. В процессе деления клеток цианобактерии создают две дочерние клетки, которые затем могут продолжить рост и деление. В режиме образования эндоспор цианобактерии образуют клетки-споры, которые могут выживать в тяжелых условиях и возобновлять размножение при благоприятных условиях. Брожение - это процесс, при котором цианобактерии производят генетически одинаковые клетки-потомки, образующие цепочки или кластеры.