Вирусы могут быть вызывающими агентами энцефалита и гепатита. Например, вирус гепатита A, B, C, D и E может вызывать различные формы гепатита, а вирусы, такие как вирус прививочного энцефалита, вирус западного нилового энцефалита и вирус клещевого энцефалита, могут вызвать различные формы энцефалита.