Особенностью строения фагоцитов является наличие фагоцитарного аппарата — специализированного комплекса органелл, который позволяет клеткам выполнять процесс фагоцитоза, то есть захватывать и переваривать частицы пищи. Фагоциты имеют особую форму с множеством псевдоподий, которые помогают захватывать и поглощать объекты. Также фагоциты обладают фагоцитарными вакуолями, в которых находится захваченный материал для переваривания.