Комбинативная изменчивость, как правило, возникает в результате скрещивания и комбинирования генетического материала различных организмов. У организмов, размножающихся только бесполым путем, такой возможности нет, так как каждый новый организм генетически идентичен своему родителю. Однако, внутривидовая изменчивость все равно может возникать из-за мутаций и других генетических изменений в геноме организма.