Мексиканский аллигатор имеет четыре конечности, каждая из которых состоит из пяти пястных костей, четырех длинных костей (лучевой и лучевая, лучезапястной и лучезапястная), а также большого числа мелких костей, образующих кисть. На задних конечностях мексиканского аллигатора также имеются пясть и плоская стопа, оснащенная пятью пальцами, каждый из которых завершается когтем. Это помогает аллигатору бегать быстро по суше и хорошо плавать в воде.