Зоология и ботаника до эры молекулярной биологии сталкивались с рядом проблем, включая:

Идентификация и классификация видов: без доступа к информации о генетических отличиях между различными видами, ученые часто сталкивались с трудностями в определении, к какому виду относится тот или иной организм.

Эволюционные отношения: без возможности анализировать генетические данные, было сложно устанавливать эволюционные связи между различными организмами.

Механизмы наследственности и развития: зоологи и ботаники сталкивались с ограничениями в понимании молекулярных механизмов наследственности и развития организмов.

Молекулярная биология помогла в решении этих проблем, предоставляя ученым инструменты и методы для изучения генетических процессов на молекулярном уровне. С помощью молекулярной биологии ученые могут анализировать ДНК, РНК, белки и другие молекулярные компоненты организмов, что позволяет им лучше понять генетические основы различий между видами, устанавливать эволюционные отношения, и изучать механизмы наследственности и развития.