Возможные проблемы в функционировании национальной платежной системы могут быть следующими:

Недостаточная защита данных и конфиденциальности. Кражи личных данных и мошенничество с использованием платежных средств могут стать серьезной проблемой для пользователей.

Высокие комиссии и платежные поручения. Некоторые платежные системы могут взимать слишком высокие комиссии за проведение транзакций, что делает их неэффективными для пользователей.

Ограничения в доступе к системе для отдельных категорий пользователей. Например, могут быть проблемы с доступом к системе для малых и средних предприятий или для граждан с низким уровнем дохода.

Недостаточная инфраструктура и техническая поддержка. Проблемы с надежностью системы, длительные сроки исполнения платежей и прочие технические неполадки могут повлиять на ее функционирование.

Недокументированные транзакции и недостаточный контроль со стороны регуляторов. Недостаточный контроль над операциями в платежной системе может стать источником финансовых мошенничеств и других преступных действий.

Для решения данных проблем необходимо улучшение законодательства, усовершенствование технической инфраструктуры и механизмов безопасности, а также повышение квалификации персонала, работающего в сфере платежных систем.