Да, это верное предложение. "Were you working late last night?" - это вопрос на английском языке, который можно перевести как "Вы работали поздно вчера вечером?". В данном предложении используется прошедшее время "were working", чтобы спросить о действии, которое произошло в прошлом, конкретно вчера вечером.