Правильнее будет сказать "Are you kidding me?" Это полная форма вопроса, в которой используется вспомогательный глагол "are". Однако в неформальной речи часто можно услышать "You kidding me?" — это более краткая и разговорная версия, которая также считается корректной в определенных контекстах. Так что оба варианта могут применяться, но "Are you kidding me?" более грамматически правильный.