Кейс (анатомия/физиология): у горных общин Тибета и Анды обнаружены разные физиологические адаптации к гипоксии — сравните механизмы (гемоглобин, кровообращение, метаболизм), предложите экспериментальные и генетические исследования для выявления причин различий и обсудите влияние культурно-экологических факторов

10 Окт в 13:40
2 +1
0
Ответы
1

Кратко вводно — у двух классических высокогорных популяций тибетцынаТибетскомплатоиандейцывАндахтибетцы на Тибетском плато и андейцы в АндахтибетцынаТибетскомплатоиандейцывАндах эволюционно сложились разные стратегии адаптации к хронической гипоксии. Ниже — сравнение по основным физиологическим системам, предложения по экспериментальным и генетическим исследованиям для выяснения причин различий и обсуждение культурно‑экологических вкладов.

1) Сравнение механизмов адаптации

Гемоглобин и транспорт O2

Тибетцы: средние концентрации гемоглобина HbHbHb у взрослых близки к низко‑ или среднолежащим популяциям — они избегают выраженной полициемии. В условиях хронической гипоксии у них обычно нормальный или лишь слегка повышенный Hb.Андейцы: характерна устойчиво повышенная масса эритроцитов и уровень Hb высокийHb—частаячертаадаптациивысокий Hb — частая черта адаптациивысокийHbчастаячертаадаптации. Это повышает содержание кислорода в крови, но увеличивает вязкость и риск хронической горной болезни.

Кровообращение и лёгочная гемодинамика

Тибетцы: повышенная дыхательная активность высокаяминутнаявентиляциявысокая минутная вентиляциявысокаяминутнаявентиляция, более высокий уровень биодоступного оксида азота NONONO в крови и возрастание регионального кровотока лучшееперфузионноеобеспечениетканейлучшее перфузионное обеспечение тканейлучшееперфузионноеобеспечениетканей. Как следствие — более низкое лёгочное сосудистое сопротивление и меньшая склонность к лёгочной гипертензии.Андейцы: часто более выраженная лёгочная артериальная гипертензия и повышенное давление в малом круге, меньшая гипервентиляция в покое по сравнению с тибетцами.

Метаболизм и тканевые изменения

Тибетцы: данные указывают на смещение к стратегиям, повышающим доставку O2 увеличениекровотока,капилляризацияувеличение кровотока, капилляризацияувеличениекровотока,капилляризация и/или на изменения в регуляции метаболизма вариациивэкспрессиигеновHIF‑путивариации в экспрессии генов HIF‑путивариациивэкспрессиигеновHIFпути, что позволяет поддерживать аэробный метаболизм при относительно нормальном Hb. Есть свидетельства сохранения массы и веса новорождённых.Андейцы: стратегия «увеличить кислородную ёмкость крови» часто сопровождается метаболическими компромиссами повышеннаявязкость,рискгипоксическойтканииосложненийповышенная вязкость, риск гипоксической ткани и осложненийповышеннаявязкость,рискгипоксическойтканииосложнений. Данные по митохондриальной функции и субклеточным изменениям менее однозначны и, вероятно, популяционно‑специфичны.

Молекулярно‑генетические ассоциации краткократкократко

Тибетцы: сильные признаки положительного отбора в EPAS1 HIF‑2αHIF‑2αHIF‑2α и EGLN1 PHD2PHD2PHD2. Важный факт — вариант EPAS1, ассоциированный с низким Hb, вероятно, пришёл через денисовский генетический вклад.Андейцы: сигналы отбора и ассоциации иные — у некоторых исследований отмечались другие кандидаты например,SENP1,ANP32Dидр.например, SENP1, ANP32D и др.например,SENP1,ANP32Dидр., а также в ряде случаев — вариации в EGLN1/других генах HIF‑пути. Важно: генетические сигналы у андеев более гетерогенны и реже столь «мощные», как у тибетцев.

2) Предлагаемые экспериментальные исследования

A. Физиологические исследования полевые+лабораторныеполевые + лабораторныеполевые+лабораторные

Популяционные кросс‑секционные и лонгитюдные протоколы: стандартизированные измерения SpO2 впокоеипринагрузкев покое и при нагрузкевпокоеипринагрузке, PaO2/PaCO2 артериальныегазыартериальные газыартериальныегазы, Hb и масса эритроцитов CO‑реинтеграционныйметоддлягемоглобиновоймассыCO‑реинтеграционный метод для гемоглобиновой массыCOреинтеграционныйметоддлягемоглобиновоймассы, капиллярная плотность биопсиякожибиопсия кожибиопсиякожи, оценка NO‑метаболитов нитраты/нитритынитраты/нитритынитраты/нитриты, лактат при нагрузке.Кардиопульмональные тесты: ЭхоКГ и допплер для оценки давления в лёгочной артерии, тесты на спирометрию и пулмональную гемодинамику во время физнагрузки, измерение минутной вентиляции и реакции на гипоксию/гиперкапнию hypoxicandhypercapnicventilatoryresponseshypoxic and hypercapnic ventilatory responseshypoxicandhypercapnicventilatoryresponses.Тесты физической работоспособности: VO2max при стандартной нагрузке в условиях нормы и гипоксии защитныекамерызащитные камерызащитныекамеры, оценка утилизации O2 при субмаксимальных нагрузках.Микроциркуляция и тканевые измерения: бесконтактная капилляроскопия, измерения тканевого кислорода near‑infraredspectroscopy—NIRSnear‑infrared spectroscopy — NIRSnearinfraredspectroscopyNIRS.Экспозиционные исследования: контролируемые краткосрочные гипоксические «вызовы» в камере для сравнения острой и акклиматизационной реакции у представителей обеих групп и у мигрантов.

B. Метаболические и клеточные испытания

Изучение митохондриальной функции на образцах мышечной биопсии или PBMC: исследования дыхания митохондрий SeahorseSeahorseSeahorse, измерение окислительного фосфорилирования, субстратного использования жирыvsуглеводыжиры vs углеводыжирыvsуглеводы.Метаболический профиль крови/мышц метаболомикаметаболомикаметаболомика: сравнение уровней лактата, кетоновых тел, фосфокреатина и др. при покое и нагрузке.Плацентарные исследования: масса плаценты, кровоток плацентарных сосудов, экспрессия HIF‑мишеней и сосудистых факторов VEGF,eNOSVEGF, eNOSVEGF,eNOS, чтобы объяснить различия в перинатальных исходах.

3) Предлагаемые генетические и молекулярные исследования

Популяционная геномика

Полное секвенирование WGSWGSWGS больших когортик тибетцев и андеев несколькосотен—тысячиобразцовнесколько сотен — тысячи образцовнесколькосотентысячиобразцов для выявления структурных вариантов и редких аллелей.Сравнительные сканы отбора XP‑EHH,PBS,iHSXP‑EHH, PBS, iHSXPEHH,PBS,iHS между популяциями и с контрольными низко‑горными популяциями.Анализ происхождения вариантов адмикшн/денисовскоепроисхождениеадмикшн/денисовское происхождениеадмикшн/денисовскоепроисхождение.

Фенотип‑генотип ассоциации

GWAS для количественных признаков Hb,SpO2,массаэритроцитов,давлениевлёгочнойартерии,ventilatoryresponseHb, SpO2, масса эритроцитов, давление в лёгочной артерии, ventilatory responseHb,SpO2,массаэритроцитов,давлениевлёгочнойартерии,ventilatoryresponse с последующим мета‑анализом между популяциями.Admixture mapping в смешанных популяциях.

Функциональная геномика

eQTL и метилирования эпигенетикаэпигенетикаэпигенетика в тканях кровь,плацента,мышцакровь, плацента, мышцакровь,плацента,мышца при нормоксии и при контролируемой гипоксии in vitro.Transcriptomics bulkиsingle‑cellRNA‑seqbulk и single‑cell RNA‑seqbulkиsinglecellRNAseq для определения клеточных эффектов вариантов в условиях гипоксии.in vitro и in vivo функциональные тесты: CRISPR‑модификация кандидатов EPAS1,EGLN1,SENP1ипр.EPAS1, EGLN1, SENP1 и пр.EPAS1,EGLN1,SENP1ипр. в клеточных линиях эндотелиальныеклетки,эритроидныепредшественникиэндотелиальные клетки, эритроидные предшественникиэндотелиальныеклетки,эритроидныепредшественники и моделях микромышимикромышимикромыши для проверки влияния на экспрессию HIF‑мишеней, продукцию NO, эритропоэз.

Генные взаимодействия и GxE

Исследования взаимодействий генов HIF‑сигналинга с генами сосудистой регуляции NOS1/2/3,VEGFNOS1/2/3, VEGFNOS1/2/3,VEGF и метаболическими путями AMPK/PRKAA1AMPK/PRKAA1AMPK/PRKAA1.Эксперименты по моделированию GxE: сравнение экспрессии и фенотипов у носителей/неносителей тех же аллелей при контролируемой нормоксии и гипоксии.

4) Конструктивный дизайн исследований / практические детали

Выборка и мощность: GWAS требуются сотни‑тысячи образцов для небольших эффектов; для кандидатных ассоциаций и функциональных корреляций — несколько сотен с тщательной фенотипизацией достаточно.Контроль за популяционной структурой и relatedness постоянныйконтрользаадмикшнидемографическойисториейпостоянный контроль за адмикшн и демографической историейпостоянныйконтрользаадмикшнидемографическойисторией.Стратегия «matching»: сравнение тибетца и андеца со схожими возрастом/полом/уровнем активности/подом культуру‑социальными факторами по возможности.

5) Влияние культурно‑экологических факторов

Время пребывания на высоте и демография: тибетцы длительно обитают на очень больших высотах и испытали сильный отбор; разные миграционные истории влияют на силу селекционного давления.Средний уровень высоты и климат: Тибетское плато и Анды различаются по абсолютному среднему высотному профилю, температуре, влажности — эти факторы меняют нагрузки на систему терморегуляции и потребность в энергии.Питание и экономическая деятельность: типичный рацион мясо/молокояковутибетцев;картофель/кукуруза/ламауандийцевмясо/молоко яков у тибетцев; картофель/кукуруза/лама у андийцевмясо/молокояковутибетцев;картофель/кукуруза/ламауандийцев и уровень физической активности пасторальныйvsсельскохозяйственныйпасторальный vs сельскохозяйственныйпасторальныйvsсельскохозяйственный влияют на метаболические требования и могут модифицировать фенотипы.Курение/дым домашнего очага, инфекционная нагрузка, доступ к медицине — все это изменяет перинатальные исходы и общую нагрузку на сердечно‑дыхательную систему.Социально‑культурные практики при беременности и родах, грудном вскармливании влияют на новорожденных и могут смещать выборочные давления на плацентарные/перинатальные адаптации.Полигамия, брачные практики и генетический поток инбридинг/аутбридингинбридинг/аутбридингинбридинг/аутбридинг влияют на распределение адаптивных аллелей.

6) Этические и практические замечания

Исследования должны проводиться с участием сообществ: информированное согласие, возврат результатов, выгоды для общины медицина,здравоохранениемедицина, здравоохранениемедицина,здравоохранение.Важно учитывать культурную чувствительность и потенциальные риски стигматизации «генетических различий».

Краткий итог

Тибетцы и андейцы демонстрируют альтернативные эволюционные стратегии: тибетцы — «повышение доставки O2» через вентиляцию, сосудистую реактивность и NO; андейцы — «повышение ёмкости крови» через полициемию. Различия обусловлены сочетанием генетических вариантов различныецелиотбораразличные цели отбораразличныецелиотбора, демографической истории, уровня и длительности воздействия гипоксии, а также культурно‑экологических факторов диета,образжизни,медицинскаяпомощьдиета, образ жизни, медицинская помощьдиета,образжизни,медицинскаяпомощь.Чтобы объяснить механизмы, нужны интегрированные исследования: строго фенотипизированные физиологические протоколы + WGS/GWAS + функциональная валидация клетки/моделиклетки/моделиклетки/модели + исследования GxE и перинатальной биологии.

Могу предложить детальный протокол конкретного исследования списокизмерений,предполагаемыйразмервыборки,лабораторныеметодыистатистическийплансписок измерений, предполагаемый размер выборки, лабораторные методы и статистический плансписокизмерений,предполагаемыйразмервыборки,лабораторныеметодыистатистическийплан под ваши цели — дайте знать, если нужно.

10 Окт в 17:19
Не можешь разобраться в этой теме?
Обратись за помощью к экспертам
Гарантированные бесплатные доработки в течение 1 года
Быстрое выполнение от 2 часов
Проверка работы на плагиат
Поможем написать учебную работу
Прямой эфир