Мухи цеце обитают в тропических и субтропических районах, часто вблизи водоемов, лесов и сельскохозяйственных угодий. Они также могут встречаться в болотистых местах, болотах и недалеко от обитателей диких животных. Мухи цеце часто ассоциируются с плодовыми деревьями и кустарниками, где они могут найти пищу и место для складирования яиц.