Море Хальмахера является частью Тихого океана, и находится между островами Хальмахера и Сулавеси. Вода соединяет Сулавеси и Малую Землю. Морские пути в этом регионе включают маршруты, проходящие вдоль побережья этих островов, а также пути, соединяющие их с другими островами Архипелага Молуккские. Море Хальмахера также является частью маршрутов для судоходства и торговли, соединяющих различные острова в этом регионе.