Наземные водоемы, такие как реки, озера и пруды, обычно имеют более доступное солнечное освещение, что способствует фотосинтезу растений и обеспечивает кислородную среду для живых организмов. В таких водоемах обитают разнообразные виды рыб, насекомые, водные растения и другие животные.

Подземные водоемы, такие как пещерные озера и подземные реки, обычно имеют ограниченное или отсутствующее солнечное освещение, что делает их более темными и холодными. Это отражается на их обитателях, которые обычно адаптированы к условиям низкой освещенности и низких температур. В таких водоемах можно найти различные виды беспозвоночных, рыб и земноводных, а также специализированные виды, приспособленные к жизни в темных пещерах.