Экологические проблемы: запуски ракет с космодрома Байконур могут привести к загрязнению окружающей среды, воздуха, почвы и воды.

Безопасность населения: в случае аварийных ситуаций при запуске ракет возможно опасное выброс радиации или токсичных веществ, что может угрожать здоровью местных жителей.

Социальные проблемы: использование космодрома Байконур может приводить к социальной напряженности среди местных жителей из-за неудобств, шума, загрязнения и других негативных последствий.

Экономические проблемы: хотя эксплуатация космодрома приносит доход в республику, но также требует больших затрат на обслуживание и решение возникающих проблем.

Политические проблемы: использование космодрома Байконур может вызывать конфликты между Республикой Казахстан и Россией, которая арендует эту территорию.

Таким образом, использование комплекса Байконыр может вызывать различные проблемы и требует тщательной оценки и управления для минимизации негативных последствий.